浙海院2010年招收全日制硕士研究生的学科专业（领域）为捕捞学、海洋生物学学术型学位和养殖、渔业、农村与区域发展、农业信息化和食品加工与安全五个领域农业推广硕士专业学位，目前均有缺额。对调剂考生学校也有优惠政策，其中学校有充足的海洋类科研项目及经费，研究生也可以申请各类项目，保证研究生在学期间有足够的项目供学习研究。同时为保证研究生圆满完成学业，学校每年提供1000元的培养学习费用补贴。

浙海院从2007年起面向全国招收硕士研究生。2007年国家规模指标11人，实招14人，捕捞学6人、海洋生物学8人；去年国家规模指标80人，实招捕捞学15人、海洋生物学35人，农业推广专业学位30人。该校正积极投入“海上浙江”建设，力争把学校办成为办学特色明显并在国内外具有重要影响的多科性教学研究型海洋大学。