北大2005年将进一步完善研究生学制改革，心理学系、新闻与传播学院、国际关系学院、经济学院、光华管理学院等9个院系硕士研究生的基本学习年限调整为2年。其他院系、学科、专业，除专业目录特殊说明外，基本学习年限为3年。博士研究生的基本学习年限调整为4年。本科起点直读博士的基本学习年限为5年，硕博连读生进入博士研究生阶段后的基本学习年限为3年。同时实行学分制和弹性学制，在保证培养质量的前提下，研究生可以提前或推后毕业。

　　自2002年开始，北大逐步设立新的重点交叉学科，如生物信息学、纳米科技等。2005年该校又将推出重点交叉学科“欧洲学”，北大欧洲研究中心将从2005年起招收欧洲学博士研究生。