应用化学专业于1986年获得学士授予权，1999年被云南省教育厅批准为首批省级重点建设专业，2006年获得硕士学位授予权。该专业是我省成立较早，规模较大，师资力量较强，科研成果最多，培养学生人数较多的专业。现有专职教师19人（其中教授4 人，副教授 7人，6人具有博士学位），云南省中青年学术与技术带头人后备人才3人，云南省1层次引进人才2人，中国化工学会无机领域学术带头人1人，中国化工学会无机盐学术与技术委员会委员1人。20年来累积培养学生近700多人，近5年来毕业生的一次性就业率稳定在90%以上，考研率达23%以上，就业的行业已涵盖了化工、烟草、医药、轻工、食品、冶金、农科、环保等行业。
应用化学系目前开设或拟开设以下的课程：
1）《应用高分子材料化学》
2）《高等有机化学》
3）《结构化学》
4）《有机化学》
5）《分析化学》
6）《超分子化学导论》
7）《纳米材料与表面清洁技术》
8）《医药功能材料》
9）《毒品分析》
10）《工业三废的处理》
11）《有机功能材料及应用》
12）《日用品化学结构化学》
13）《化学信息学》
14）《环保催化材料》
15）《当代环境问题与科学对策化学》
16）《微型半微型有机化学实验》等课程
目前正在进行《高等有机化学》精品课程的建设，重点建设《超分子化学导论》，《纳米材料与表面清洁技术》两门双语课程以及《应用高分子材料化学》等精品课程。
我系积极培养、引进高层次人才，努力建设成一支适应高质量教学要求的中青年骨干教师队伍。我系还拟选留或引进高分子化学与物理、功能材料、生物医用材料、精细化工、环境工程等方面的博士，选派青年教师到外校攻博或出国进修。力争使本专业教师队伍学历层次高，年龄结构合理，团结进取。
在教学手段方面我们鼓励教师进行教学方法、教学手段的更新。并加强专业实验室建设，完善“应用化学实验室”，拟新建“高分子化学实验室”、“高分子物理实验室”、“功能材料实验室”等。
我系还建立了长期稳定的实习基地：我们与云大科技，云南省烟草研究院，云南省质量监督局，昆明农药厂，昆明中科生物公司等单位建立长期合作关系，使上述单位成为应用化学专业学生稳定的生产实习基地。
应用化学专业的特点是培养口径宽，能在医药、生物技术、化学、化工、材料、能源、环境、卫生、公安、海关、产品质量检测等各部门从事科学研究、科技开发、管理及各种技术工作，因此社会对应用化学人材的需求量日益增大。
应用化学专业自1986年以来，经过二十年的建设，已形成了以天然产物提取工艺、精细化学品工艺及环境工程等稳定的方向，其专业实力、教学质量、科研及生产开发方面，在全省相关专业中有领先的地位。在科技开发、成果转化方面更是成果卓著。在学科建设上，向产、学、研立体化的方面发展。在已有的基础上，更一步明确学科的发展方向，要在精细合成，药物化学、绿色化学、功能化学方面形成特色、突出为地方经济建设培养应用性人才的特点，其总体构想是以学科建设为龙头，以师资建设为核心，通过5年左右的时间，将应用化学专业建设成为校内一流、省内有示范作用的重点专业，对我省建设绿色经济强省及大力发展云药都将起到积极的推动及支撑作用。
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