山西医科大学体育教学部成立于2003年10月，其前身是基础医学院体育教研室，现以发展成为一个独立的部门。体育教学部主要承担着我校本科，以及七年制学生的公共体育教学任务，此外还承担着学校运动会，学生各单项比赛的组织承办和群众体育工作，学校运动代表队的训练和比赛任务，以及学生体质健康测试工作。在教学方面，教学部主要采用分项课教学，目前我部所开设项目主要有：足球、篮球、排球、乒乓球、健美操、体育舞蹈、跆拳道、武术、普修等项目。
体育教学部现有主任，直属支部书记，直属支部副书记，副主任，办公室，以及两个教研室等机构。
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