系统科学是我校重点发展的新兴交叉学科之一，是同时拥有“系统理论”硕士和博士学位授权的学科。学科主要依托青岛大学复杂性科学研究所，拥有以中国科学院院士张嗣瀛教授为首，多名年轻教授、副教授和博士加盟的复杂性研究团队，现有硕士生导师5人（其中有企业兼职导师1人）。复杂性科学研究所主办有全国性学术刊物《复杂系统与复杂性科学》，是设在中国科学院的全国“系统复杂性研究中心”的组成单位之一。

　　2002年5月在青岛大学成功主办了“系统复杂性”国际研讨会（International Symposium on System Complexity），到会的有包括Santa Fe Institute 及IEEE SMC杂志主编在内的国内外专家80余人。2004年7月与美国Santa Fe Institute联合在青岛大学举办复杂系统暑期学校（Complex Systems Summer School），促进了复杂系统与复杂性科学领域的学术交流。

　　本学科从工程系统为基础的系统工程，正在向以复杂系统为主题，以突现系统、进化、自适应等生物系统，人类智能、社会组织、经济、管理等为研究对象，以信息为突破口的复杂性科学方向发展。已获多项国家和省部级科技进步奖，发表学术论文200余篇（其中SCI、EI收录150余篇）。目前正在承担着包括系统科学、管理科学、地球科学及863计划等多项国家、省部级科研课题。