北京中医药大学附属东直门医院神经内科（脑病科）， 是在全国中医医院中率先建立起来的神经内科专业科室。经过20余年的发展建设，在中医脑病的研究领域处于国内领先地位。1998年被国家中医药管理局确定为全国中医脑病医疗中心建设单位，2001年被国家中医药管理局确定为中医脑病重点学科及重点专科建设单位。神经内科（脑病科）具备经颅多普勒（TCD）、数字脑电图、肌电图等专科检查设备，设有神经心理测查室、康复训练室（PT、OT）等。专业技术人员中60%以上具有医学博士、硕士学位。
北京中医药大学中医内科是1989年国家教委确定的全国高等中医院校重点学科，2001年再次以优异的成绩进入教育部重点学科行列。脑病研究领域一直是中医内科学科建设中的第一稳定的研究方向，脑病研究室是国家中医药管理局重点建设研究室，其中的脑病实验室已通过国家中医药管理局三级实验室验收，并成为北京市普通高等学校重点实验室的重要组成部分。
中医脑病学科在学术带头人王永炎院士带领下，始终重视学科内涵建设，在80年代初就开展了中医病证规范化研究，至今已制定了第一代、第二代中风病中医诊断疗效评定标准及中风病证候诊断标准，并推广全国。以中医药治疗神经内科常见病及疑难病为主要内容，以脑血管病和老年期痴呆为重点研究方向，经过多年的科学研究和实践积累，形成了从预防、治疗到康复的系统干预方案，其中化痰通腑法及清开灵注射液治疗中风病痰热证均在理论与方法上有所突破，并在全国推广。九五期间又对老年期血管性痴呆进行了系统研究，并针对毒损脑络病机理论及扶正护脑法，从临床及分子生物学方面进行了探讨。在中医药治疗帕金森氏综合征、遗传性小脑共济失调、多发性硬化、肝豆状核变性等疑难性疾病方面进行了初步研究，对失眠、偏头痛等常见病症积累了丰富的治疗经验，筛选出有效方药。
七五以来本学科连续承担了国家科技攻关项目，已获得国家科技进步三等奖3项，省部级、市级科技成果奖20余项。已培养博士研究生32名，有6名博士后人员已出站。目前，王永炎院士做为首席科学家承担了国家重点基础研究发展规划资助项目（973）中药方剂关键问题的基础研究。本学科目前承担着国家十五攻关课题中风病急性期综合治疗方案研究、还承担国家自然科学基金课题2项、教育部博士点基金课题2项、人事部课题2项、国家中医药管理局课题1项、北京市科委课题1项、科技部基础性工作专项基金子课题1项、首都医学发展科研基金项目等。
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