中医临床基础学科是北京市重点学科，它是研究中医辨证论治基本规律、为临床提供理法方药综合运用的方法和思路，以提高临床疗效为最终研究目标的一门学科，是联系中医基础学科与临床学科的桥梁。本学科带头人为北京中医药大学副校长王庆国教授，现有成员26人，其中教授12人，副教授8人；具有博士学位者8人，硕士学位者10人；博士生导师4人，硕士生导师12人；有3人享受国务院政府特殊津贴。

　　本学科有3个稳定的研究方向：1.经方防治常见病、疑难病的研究；2.经方配伍规律及作用机制的研究；3.中医临床辨证论治体系的研究。

　　本学科设《伤寒论》、《金匮要略》、《温病学》三门课程，是中医四大经典课程的主体，历来就是传统中医教育的核心。

　　本学科科研实力雄厚，曾主持国家级科研项目4项，部局级28项；发表学术论文700余篇；主编、副主编专业著作近百部，统编全国教材4部；获国家专利2项；国家级成果奖1项、部局级成果奖6项。

　　本学科是国家最早的中医硕士、博士点和博士后流动站授予单位，已为国家培养博士研究生21人，硕士研究生45人。