制药工程专业创建于2007年。本专业已有专业教师11人，现有教授4人，副教授5人，其中博士8人， 45岁以下教师均已获得硕士以上学位。本专业依托有机化学省级重中之重学科，拥有六百多万元的先进仪器设备，科研条件良好。近年来，本专业教师已经主持承担了包括国家自然科学基金项目、教育部新世纪人才计划资助项目、国家863计划、国家科技支撑计划、浙江省自然科学基金人才项目、面上项目、浙江省绿色化工重大专项、浙江省科技计划等省部以上项目30余项、授权发明专利2项、浙江省人民政府科学技术二等奖1项，发表SCI、EI收录论文七十余篇，部分科研成果已经工业化。

　　培养目标：培养以化学、工程学和药学为基础，掌握化学制药及生物、中药制药的基本理论、基本知识和基本技能，具有化学合成新药的研制、各类制药的生产工艺研究、生产过程与产品质量控制及生产管理的高级工程技术人才。

　　主要课程：有机化学、物理化学、药学、化学工程、药物化学、化工原理、化工仪表及自动化、药物合成反应、药物分析、药剂学、制药反应工程基础、波普分析、制药工艺学、药物高分子材料学等。

　　就业方向：有关制药企业、科研单位、高等院校及医药公司等部门从事生物药物的研究与开发、生产、经营和管理、药物检验、新药报批、外贸、医药代表、营销等工作，也可报考有机化学、应用化学、高分子化学与物理和课程与教学论（化学教育方向）的硕士研究生。