内蒙古农业大学动物科学与医学学院的动物医学专业始建于1952年。新中国成立后，为了使内蒙古自治区走上经济建设和社会发展的快车道，解决畜牧业发展中急需和迫切的大量高级专门人才，中央人民政府决定，在内蒙古创办全区第一所本科高等学校?“内蒙古畜牧兽医学院”(后改称“内蒙古农牧学院”)。为了筹建这所学校，政务院决定将河北、平原、山西三所农学院的畜牧、兽医专业成建制地迁到呼和浩特市。学院成立时，国家有关部门从全国十几所农林类高校调集了数十名从事兽医专业（现为动物医学专业）教学的高级知识分子参加学校的创办工作及教学活动。以全国著名病理学家张荣臻先生为代表的老前辈，他们长期扎根边疆，艰苦奋斗，自力更生，严于治学，不断进取，终身献身于内蒙古草原畜牧业事业，为草原畜牧业的发展做出了卓越的贡献。在他们的感召下，动物医学专业逐步建立起了一支稳定的长期甘为草原畜牧业和边疆地区服务终身的高素质教师队伍。
自1963年兽医病理学开创自治区研究生教育先河以来，1997年基础兽医学科获得博士学位授予权， 2003年兽医学科成为一级学科博士学位授权点。1985年，兽医病理学科(后扩大为基础兽医学科)被评为内蒙古自治区重点学科。2006年基础兽医学又被评为自治区重点实验室。此外，相关的畜牧学科也成为一级学科博士学位授权点。动物遗传育种与繁殖学实验室为内蒙古自治区重点实验室；动物营养与饲料学、和动物遗传育种与繁殖学为内蒙古自治区重点学科。2007年 “家畜育种学”被评为国家级精品课程，“家畜病理学”和“中兽医学”被评为自治区级精品课程；“家禽生产学”被评为校级精品课程。
在教材体系建设方面，本专业教师主编全国性教材7部，副主编10部，参编18部，分别获国家级优秀教材一、二、三等奖各4、3、3项；自治区优秀教材一、二、三等奖各8、10、3项。获国家教学成果二等奖1项，自治区教学成果一等奖1项，二等奖2项。此外，还主编出版了蒙文教材6部；校内教材12部，其中蒙文教材5部。这些教材为学科建设奠定了良好基础。
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