新疆农业大学动物医学学院创始于1952年，已有50多年的发展历史。现有在册教工44人，本科生897人，研究生167人。历年来共为国家输送本专科毕业生5千余人。目前设临床兽医学、预防兽医学、卫生检验3个本科专业。1984年获基础兽医学硕士授权点，1986年分获预防兽医学、临床兽医学硕士授权点。是学校硕士学位授权最早、专业最多的学科之一。2006年又被批准为动物医学一级学科硕士授权点。2002年被批准为兽医硕士专业学位授权点（一级学科）。

新疆农业大学动物医学学院目前仪器设备总价304万元，拥有各类教学用房建筑面积4582 平方米。共培养硕士研究生121名，主持国家和省部级研究课题20余项，获省部级科技进步二等奖1项，三等奖5项，四等奖1项；共为地方诊治家畜病例18.2万多头次。出版专著9部，大学与研究生教材21部，其中《动物细胞病理学》获国家教育教学成果二等奖、自治区和学校优秀教学成果一等奖。《家畜生理学》、《畜禽病理学》等少数民族文字教材获全国少数民族优秀教材二等奖。一人获得首届自治区高等学校教学名师称号。