福州大学土木工程学院的前身为土木建筑工程系，成立于1959年。改革开放以来，土建系各项事业都有了很大的发展，1998年成立了土木建筑工程学院，2005年另立建筑学院，原学院更名为土木工程学院。学院现设有建筑工程系、道路与桥梁工程系、轨道与地下工程系、市政工程系、工程管理系、交通工程系、水利水电与港口工程系等七个系，结构工程研究所、桥梁与隧道工程研究所、水工结构研究所、岩土工程研究所、防灾减灾工程及防护工程研究所等五个科研结构。现有教职员工156名，专任教师115人，其中教授29名（含讲座教授2名、双聘教授1名），副教授37名，讲师45名，具有博士学位和硕士学位的教师各占一半，享受政府特殊津贴的有突出贡献的专家6名。
学院现有土木工程、给水排水工程、工程管理、交通工程、水利水电工程等本科专业五个，在校本科生1800多名；有土木工程一级学科硕士点、水工结构工程和工程力学等二级学科硕士点，现有在学硕士研究生200余名；有建筑与土木工程、水利工程二个工程硕士点，另有一个工程管理专业硕士点，在学工程硕士200余名；有土木工程一级学科博士点和博士后科研流动站，在学博士生60余名，在站博士后多名。土木工程实验教学中心2009年被评为国家示范中心。
学院涵盖了土木工程、水利工程、交通运输工程等多个一级学科，其中土木工程学科为支柱学科。2007年结构工程被评为全国重点（培育）学科，“土木工程新技术与防震减灾”进入国家211工程三期建设。以本学院为建设单位，联合福建省地震局和台湾大学共同建设的“福建省海峡两岸土木工程防震减灾工程研究中心”正在建设中，地震模拟振动台三台阵系统已经建成。经过长期的努力土木工程一级学科已形成了6个稳定的、具有特色和优势的研究方向：混凝土结构与预应力技术；钢与组合结构；新型桥梁结构、岩土强度理论与应用、结构稳定与振动、工程防灾与减灾。
土木工程学院设有土木建筑设计研究院、土木工程建设监理有限公司和技术开发部等科技开发单位，承担了大量的建筑规划、设计以及道路和桥梁的勘测设计、监理等任务，为把我院的科学研究成果转化为生产力、为高校服务社会发挥着重要的作用，为海峡西岸经济区建设和区域经济建设做出了积极的贡献。
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