生物物理系的前身是基础部的物理教研室和同位素教研室， 1995 年，物理教研室和同位素教研室合并，组建成生物物理教研室。 2002 年基础部更名为理学院后，生物物理教研室更名为生物物理系。
现有专职教师11人，专职实验技术人员3人。其中：教授1人，副教授3人，讲师4人，助教3人，实验师1人，高级工程师1人，助理实验师1人；博士生导师1人；拥有博士学位1人，拥有硕士学位8人，在读博士3人，在读硕士2人。生物物理系教师多毕业于吉林大学、哈尔滨工业大学、东北师范大学等国内知名的重点大学，经过多年科研与教学工作的合作，现已形成一支团结向上、富于创新的教师队伍。
生物物理系承担全校大学物理、大学物理实、同位素应用技术等本科生基础课，以及同位素示踪技术、核技术应用专题、放射生物学等硕士博士研究生课程，其中大学物理课程为东北农业大学校级精品课。近年，生物物理系主编全国高等农林院校“十一五”规划教材两部，校立项教材两部，主持黑龙江省教育厅教学研究课题、东北农业大学教育教学研究课题多项，发表教学改革与研究论文 10 余篇。
生物物理系招收生物物理学专业硕士研究生，研究方向有：同位素示踪技术、辐射生物学效应等，本专业有博士生导师1人。物理学与农业科学、物理学与生物学领域的交叉研究一直是生物物理系科研的主攻方向。近年，生物物理系主持黑龙江省自然科学基金课题、黑龙江省科技厅科学研究课题、黑龙江省教育厅科学研究课题多项，发表学术论文 40 余篇。
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