植物病理学科1982年开始招收硕士研究生，1986年获得硕士学位授予权，1988年被确定为黑龙江省重点学科，2001年通过黑龙江省重点学科重新审定。为国家“211工程”重点建设学科之一，也是黑龙江省植物病理学会挂靠单位。以本学科为依托之一的“寒地作物生理生态实验室”为农业部重点开放实验室。本学科现有教师9人，其中教授3人，副教授2人，讲师2人，助教1人，高级实验工人1人。4人具有博士学位，在读博士2人。

本学科设置四个研究方向：

　植物病害流行、植物病害预测预报及综合治理；
　植物抗病性、抗病生理及药理；
　植物病害生物防治及绿色植物农药的综合利用；
　植物病毒学。学科总体目标为整体达到国内先进水平，部分领域达到国际先进水平或国内首创。

　　本学科在“九五”、“十五”期间共承担科研项目25项，其中国家级项目7项，省部级项目18项，总经费200万元。有四项成果被采用：减缓大豆重迎茬损失的农艺措施及有效制剂研究；利用宽行种植，地膜覆盖技术防治南瓜疫病；利用新型复合农药一克疫缓释剂防治南瓜疫病；重迎茬大豆减产原因与机理的研究。获省部级科研奖20余项，发表论文200余篇，主编和参编学术专著20余部。本学科点设三个实验室：植物分子病理学实验室；植物病害流行、预测预报及综合治理实验室；普通植物病理学实验室和一个微机室，实验室面积1000平方米，温网室1100平方米，并配有一定面积的实验用地。本学科点仪器设备总价值200多万元，其中万元以上仪器设备20台件，可开展由普通植物病理学到分子植物病理学的全部研究工作。