中医外科学专业是我校2000年增列的硕士学位授予点，其临床基地在学院第一附属医院普外科，学科实力雄厚，有主任医师2人，副主任医师3人，副教授3人。学科旨在培养既能掌握现代外科卓越技术，又能掌握中医外科研究方法，努力把传统中医学和现代外科学高层次、高水平结合起来的硕士人才。

　　主要研究方向：①中医药防治恶性肿瘤的研究；②中医药防治急腹症研究；③中医药防治乳腺疾病研究；④中医药防治四肢血管疾病研究；⑤中医药防治疮疡及皮肤病研究；⑥中医药防治鼻病的临床研究。

　　目前承担的科研项目有国家中医药管理局和安徽省高校自然科学基金各一项（胃癌术后早期滴注健脾通进而中药对细胞免疫和肠粘膜通透研究）。中药在上胃肠道手术后早期应用研究“获省高校科技进步奖”。硕士点临床基地普外科下附三个重点学科组：胃肠外科、肝胆外科、甲状腺乳腺血管外科。各分支学科均有在国内和省内知名教授把关，并分别担任全国专业组、省专业组主任委员、副主任委员和委员职务。每年在国内、外发表中、英文论著数十篇，其中数篇被国外权威检索机构《Medline》收录，在国内外有较高的影响力和知名度。