计算机软件与理论专业1998年获批成为硕士学位授予点，2000年获批准成为信息产业部重点学科，2002年批准成为浙江省重点扶植学科，同年软件工程获批成为工程硕士培养领域。

　　经过二十多年的发展，本学科已形成了一支具有较高水平和学术研究队伍，学术研究队伍阶梯结构合理、学历层次高、思维活跃、爱岗敬业，富有创新精神。本学科中拥有教授5人，副教授16人，博士6人，浙江省中青年学术带头人2人。

　　本学科拥有信息产业部计算机应用技术重点实验室、网络教育技术、虚拟现实及网络信息安全两个国家财政部专项基金资助的重点实验室以及软件研发中心、软件技术研究所等多个科研机构，主要研究方向有信息系统与信息处理、网络信息安全、数据库与系统集成、网络教育技术、虚拟现实与多媒体等。

　　近年来，本学科承担了国家863、国家与省级自然科学基金、军事电子预研、预研基金、重点实验室基金、信息产业部电子产业发展基金以及浙江省重点科技攻关等多项科研项目。其中“密码新技术研究”获得电子部科技进步二等奖，“面向21世纪计算机基础教学改革”获国家优秀教学成果二等奖、“计算机上机考试测试软件”获浙江省科技进步三等奖。本学科长期为政府部门、企事业单位从事科技开发任务，其中外贸企业综合信息化集成商务平台、浙江省网上招生录取系统等得到广泛的应用推广，取得了较好社会效益与经济效益。

　　本学科承办了“虚拟现实及其在工业中应用VRAI‘2002”、“Petri网2003年学术会议”等国际、国内会议，并和国内外高校、科研院所开展广泛的学术交流。本学科还和德国Anhatt大学、爱尔兰都柏林城市大学、英国阿伯泰邓迪大学等开展师资交流、科技合作、学生交流等多项合作。

　　本学科带头人张国煊教授长期从事人工智能、信息处理与信息系统等方向的研究工作，完成国家863、国家CAD应用工程示范项目、信息产业部电子产业发展基金、浙江省科技攻关项目等多项，并有4项成果获省部级奖励。

　　2001年，以计算机软件与理论学科为基础，成立浙江省属高校中第一家软件学院，在省内高校中开展2+2转校、转专业的人才培养工作，并取得良好的成果。