经国务院学位评定委员会批准（学位办[2009]35号文件），我校成为教育硕士培养的单位。黑龙江大学教育硕士专业学位教育中心设立在教育科学研究院。
黑龙江大学教育科学研究院前身为1988年建立的黑龙江大学高等教育研究所，现设有教育经济与管理、高等教育学两个科学学位硕士点和教育硕士（教育管理方向）专业学位点，设有教育学、应用心理学两个本科专业。现有在校硕士研究生50人，本科学生400人。全院现有教职员工43人，专任教师28人，其中教授5人，具有博士学位10人，在读博士5人。近年来承担国家级、省部级等科研项目60余项，发表高质量学术论文200篇，出版著作20多部，并获得省部级等各级奖励10余项。现开始面向全国招收在职攻读教育硕士（教育管理方向）专业学位研究生。
教育硕士专业学位是具有特定教育职业背景的专业性学位，主要培养面向基础教育管理和教学工作需要的高层次专门人才。开展在职人员攻读教育硕士专业学位教育工作，是对基础教育管理和教学人员实施正规、系统、高水平的学位教育，旨在加强基础教育管理和骨干教师队伍的建设，培养和造就一批政治、业务水平较高的应用型、创新型教育管理人才。该学位获得者应具有良好的职业道德，既要掌握某门学科坚实的基础理论和系统的专业知识，又要懂得现代教育基本理论和教育管理或学科教学的理论及方法，具有运用所学理论和方法解决教育管理实践或学科教学中存在的实际问题的能力，还要能比较熟练地阅读本专业的外文资料。
我校招收的在职人员攻读教育硕士专业学位研究生的培养，以在职兼读的方式进行，纳入我校研究生培养计划。教学标准、课程学习内容和学分要求按国务院学位委员会办公室组织专家编写的教育硕士专业学位参考性培养方案和教学大纲掌握。学习年限为二至四年，课程学习实行学分制。我校对报考教育硕士专业学位的考生，录取后将利用假期集中授课。学位课程考试通过后，可以在职研修、撰写学位论文。对课程考试合格、修满规定的学分、学位论文答辩通过者，授予教育硕士专业学位，颁发国务院学位委员会办公室统一印制的教育硕士学位证书。
报考条件是国民教育序列大学本科或本科以上毕业并取得毕业证书(一般应有学位证书)的在职普通中学、小学、幼儿园和其他中等学校的教师或管理人员，以及省、市、区、县教育研究部门或政府机关教育系统中有相当于中学、小学、幼儿园教师职务的教研员或管理人员。
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